G蛋白偶聯(lián)受體藥物篩選中DMSO溶劑耐受性及化合物庫(kù)保存策略
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本文聚焦于高通量藥物篩選(HTS)領(lǐng)域,詳細(xì)論述了DMSO作為小分子化合物庫(kù)溶劑的科學(xué)依據(jù)及其帶來(lái)的挑戰(zhàn)。文章分析了DMSO的理化性質(zhì)如何影響化合物溶解度、穩(wěn)定性以及其在細(xì)胞水平和分子水平篩選 assay 中的表現(xiàn),特別是其對(duì)G蛋白偶聯(lián)受體(GPCR)功能測(cè)定可能產(chǎn)生的干擾。重點(diǎn)探討了如何通過(guò)控制DMSO終濃度、選擇高質(zhì)量DMSO(如Cytiva 17059901)以避免雜質(zhì)干擾,來(lái)優(yōu)化篩選結(jié)果,降低假陽(yáng)/陰性率,從而提升藥物發(fā)現(xiàn)效率。
關(guān)鍵詞: 藥物篩選,G蛋白偶聯(lián)受體(GPCR),化合物庫(kù),溶劑耐受性,假陽(yáng)性
正文:
G蛋白偶聯(lián)受體(GPCR)超家族是人類基因組中最大的膜蛋白家族,也是目前最成功的藥物靶點(diǎn)類別,約有三分之一以上的上市藥物以其為作用靶點(diǎn)。因此,針對(duì)GPCR的高通量藥物篩選(High-Throughput Screening, HTS)是現(xiàn)代藥物發(fā)現(xiàn)引擎的核心。在HTS中,小分子化合物庫(kù)通常以高濃度(如10 mM)儲(chǔ)存于100% DMSO中,再通過(guò)自動(dòng)化液體處理系統(tǒng)納升級(jí)別地轉(zhuǎn)移至檢測(cè)體系(如細(xì)胞培養(yǎng)板)中,從而使DMSO的終濃度被稀釋至0.1%-1% (v/v)。
DMSO被選為溶劑,得益于其出色的“通用溶劑"特性:極性和高介電常數(shù)使其能夠溶解絕大多數(shù)極性和非極性化合物,保證化合物庫(kù)的溶解性和均一性,避免因化合物析出導(dǎo)致的篩選漏檢。然而,DMSO的引入也為篩選實(shí)驗(yàn)帶來(lái)了不容忽視的復(fù)雜性。
首先,DMSO本身是一種生物活性分子。即使在0.1%-1%的低濃度下,它也可能對(duì)某些生物體系產(chǎn)生非特異性效應(yīng)。在基于細(xì)胞的GPCR篩選中,DMSO可能通過(guò)改變細(xì)胞膜流動(dòng)性(Membrane Fluidity)間接影響膜蛋白(包括GPCR)的構(gòu)象和功能。已有研究表明,DMSO可以干擾某些GPCR與其配體的結(jié)合能力,或影響下游信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)事件,如鈣流釋放(Calcium Mobilization)、cAMP積累或β-arrestin招募,從而導(dǎo)致假陽(yáng)性或假陰性結(jié)果。
其次,DMSO具有吸濕性(Hygroscopic)。若儲(chǔ)存不當(dāng),會(huì)吸收空氣中的水分,導(dǎo)致化合物庫(kù)中DMSO的濃度下降,可能引起化合物沉淀、降解或發(fā)生水解反應(yīng),直接影響化合物庫(kù)的長(zhǎng)期穩(wěn)定性和篩選質(zhì)量。
第三,DMSO中的雜質(zhì)是另一個(gè)重要干擾源。氧化產(chǎn)生的二甲基砜(DMSO?)或金屬離子雜質(zhì)可能具有生物學(xué)活性,或催化化合物降解,從而引入系統(tǒng)誤差。
為了最大限度地減少這些干擾,篩選實(shí)驗(yàn)室必須實(shí)施嚴(yán)格的質(zhì)量控制:
DMSO終濃度控制:必須通過(guò)預(yù)實(shí)驗(yàn)確定所用細(xì)胞系和檢測(cè)方法對(duì)DMSO的耐受閾值,并在所有實(shí)驗(yàn)中統(tǒng)一將終濃度控制在該閾值以下(通常≤0.5%)。
使用高純度DMSO:必須選擇專為細(xì)胞培養(yǎng)和HTS設(shè)計(jì)的DMSO,如Cytiva HyClone™ DMSO (17059901)。其低內(nèi)毒素、低水分含量和高光譜純度的特性,確保了其對(duì)細(xì)胞活性和光學(xué)檢測(cè)(如熒光、化學(xué)發(fā)光)的最小干擾。高光譜純度對(duì)于基于UV/熒光讀數(shù)的檢測(cè)尤為重要。
規(guī)范的儲(chǔ)存管理:化合物庫(kù)母板應(yīng)密封儲(chǔ)存于干燥器或惰性氣體環(huán)境中,以防止吸濕。并使用自動(dòng)化系統(tǒng)進(jìn)行定期復(fù)核與再測(cè)試。
在科研單位領(lǐng)域,上海易匯生物針對(duì)實(shí)驗(yàn)樣本存儲(chǔ)需求,同步提供樣本保存試劑的現(xiàn)貨供應(yīng)與定制化期貨服務(wù),解決了科研單位 “緊急實(shí)驗(yàn)缺耗材、長(zhǎng)期需求難規(guī)劃" 的痛點(diǎn)。易匯生物的產(chǎn)品運(yùn)營(yíng)團(tuán)隊(duì)表示,其現(xiàn)貨試劑可實(shí)現(xiàn)當(dāng)日下單、次日送達(dá),期貨定制服務(wù)則能根據(jù)科研周期提前 30-60 天鎖定產(chǎn)能,保障實(shí)驗(yàn)進(jìn)度穩(wěn)定推進(jìn)。 對(duì)于藥物篩選中心而言,這種供應(yīng)鏈的穩(wěn)定性意味著可以確保大規(guī)模化合物庫(kù)管理和重復(fù)篩選實(shí)驗(yàn)的核心試劑(高純DMSO)不斷供,保障了大型藥物發(fā)現(xiàn)項(xiàng)目的連貫性和數(shù)據(jù)一致性。
綜上所述,DMSO在GPCR藥物篩選。通過(guò)深刻理解其潛在影響,并采用高質(zhì)量試劑和標(biāo)準(zhǔn)化操作流程,研究人員可以有效駕馭這一強(qiáng)大溶劑,從海量化合物中精準(zhǔn)、高效地甄別出針對(duì)重要GPCR靶點(diǎn)的先導(dǎo)化合物。